Niška  Banja  spada   u   naša   najradioaktivnija   prirodna   lečilišta,   Voda dva topla radioaktivna vrela: Glavno vrelo i Suva banja - izbija iz krečnjaka. Glavno vrelo je jak izvor vode temperature 39°C i prosečne izdašnosti oko 50 litara u sekundi (maksimalno 120 lit/sek.). Temperatura Suve banje je niža a kapacitet ovog vrela je veoma promenljiv, od 14 do 42 litra u sekundi.

Režim izdašnosti Suve banje je i interesantan. Do 1932. ovo vrelo je radilo periodski, za vreme i posle kiša. Juna te godine, posle izgradnje, vrelo je stalno izbacivalo vodu. Međutim, u periodu od 1945. do 1952. godine povremeno je presušivalo, najčešće u sep­tembru (sezona lečenja). Naknadnim hidrotehničkim radovima, spuštanjem otvora vrela, rešen je problem presušivanja vrela, zamućivanja i rashlađivanja njegove radioaktivne vode. Niža temperatura vode Suve banje pogoduje bolesnicima, kojima je voda Glavnog vrela suviše topla. Pored ostalog, u vodi Glavnog vrela ima manjih količina olova i bakra, kao i tragova urana. Topla radio­aktivna voda za piće koristi se sa česme iza Novog kupatila.

Hladnu radioaktivnu vodu za piće daju dve Česme, jedna u parku a druga kod škole. "Školska česma" ima i najradioaktivniju vodu, i postojanu temperaturu od 17,2°C. I ostale vode Niške Banje su radioaktivne, a takođe i gasovi u vodi, koji su zastupljeni u velikoj količini.

Glavno kupatilo sa dva bazena nalazi se u središtu Banje, a snabdeva se vodom od Glavnog vrela. Količina lekovite vode, njena temperatura i radio­aktivnost promenljivi su tokom godine, naročito posle kiša i topljenja snega. Otuda temperatura vode Glavnog vrela varira između 39 i 28°C. U litru vode ovog vrela ima natrijuma,  kalcijuma, magnezijuma i kalijuma, a od anjona najviše su zastupljeni hidrokarbonat, sulfat, hlor i nitrat. U vodi ima koloidalno rastvorenog silicijum-dioksida, gvozda i aluminijum oksida, kao i slobodne ugljene kiseline.

Lečenje u Niskoj Banji se obavlja kupanjem u radioaktivnoj vodi, pije­njem mineralne vode i inhaliranjem, zatim elektroterapijom, kineziterapijom i peloidoterapijom. Za piće se koristi topla radioaktivna voda iz dveju česama u Novom kupatilu i jedne kod starih bazena, kao i hladna radioaktiv­na voda "Školske Česme". Vode ovog prirodnog lečilišta leče bolesti lokomotornog aparata i respiratornih organa, nervne bolesti i nesanicu, opštu zamorenost, posledice povreda mišića i zglobova, zatim povećani krvni pritisak, oboljenja želuca i creva na nervnoj bazi, poremećaje žlezda sa unutrašnjim lučenjem,  poremećaj  metabolizma,  ginekološka   oboljenja. One su veoma pogodne za lečenje reumatizma, astme i srčana oboljenja (postinfarktno stanje, nervoza srca), a kontraindicirane su za tubrekulozu, tu­more, akutne zarazne bolesti, teža oboljenja srca, bubrega, nervnog sistema.